Premesso che Linux (e non Linus) e Ubuntu sono la stessa cosa, in quanto Ubuntu è una delle tante distro di Linux, infatti Linux è solamente il nome del kernel.
Per quanto riguarda la tua domanda, dipende da cosa devi farci, in quale ambito lo devi utilizzare; in quanto ogni sistema operativo ha dei lati postitivi e dei lati negativi.
Per non rimanere qui ore a spiegare i pregi e i difetti di uno e dell'altro ecco alcuni link
uno per Linux:
http://it.wikipedia.org/wiki/Unix
uno per Ubuntu Linux:
http://it.wikipedia.org/wiki/Ubuntu
e uno per Windows:
http://it.wikipedia.org/wiki/Windows
Per opinione personale, comunque, io preferisco Linux, ma li uso entrambi.
Per approfondimenti e chiarimenti puoi contattarmi per e-mail.
http://it.wikipedia.org/wiki/Fear,_uncertainty_and_doubt
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